O Άγιος Στέφανος Ναυπάκτου βρίσκεται στη δυτική πλευρά της πόλης.
Ο Ναός είναι λιθόκτιστος στον τύπο της ξυλόστεγης κεραμοσκέπαστης βασιλικής χωρίς τρούλο. Κτίσθηκε πιθανώς το 1847 ενώ στον ίδιο χώρο εντοπίσθηκε βυζαντινή και παλαιοχριστιανική φάση του μνημείου.
Στο χώρο του σημερινού 2ου Δημοτικού Σχολείου υπήρχε Κοιμητήριο, γι’αυτό στη μνήμη πολλών θεωρείται Κοιμητηριακός ναός ενώ στον ευρύτερο χώρο εντοπίσθηκε και παλαιοχριστιανικό κοιμητήριο. Διοικητικώς υπάγεται στο Μητροπολιτικό ναό της πόλης.
Ο ναός έχει ανακαινιστεί και πανηγυρίζει στίς 27 Δεκεμβρίου.